对于是否兴建垃圾焚烧电站，国内专家亦有很多争议。而民众最大担忧则是，垃圾焚烧发电是否会排出有毒物质二恶英。

　　“反烧派”的赵章元告诉记者，日本的焚烧炉数世界最多、技术亦为最先进，但纵使如此依然有二恶英所导致的环境污染及癌症事故发生，“值得中国警惕”。

　　北京奥北志愿者研究小组提供的国外研究数据表明：美国的医疗垃圾焚烧厂数量已经从1988年的6200座，减少到2008年的57座，萎缩99%；全世界拥有垃圾焚烧炉数量最多的日本，也从高峰期的6000余座下降到1280座。

　　支持派则对此不以为然。“填埋和堆肥所产生的二恶英是焚烧的几千倍，对人体危害更大，为什么要选择危害更大的方式呢？”王圣泉对记者解释，无论是先前北京六里屯还是广州番禺垃圾发电项目遇阻事件，很大因素是先前该地为比较大的垃圾填埋场，对该地民众的身体健康已造成影响，居民对建设垃圾电厂存在心理障碍。

　　在王圣泉看来，依目前中国的国情，地少人多，堆肥与填埋成本很高，烘干固化的成本至少是焚烧的一倍以上，故大多数城市只有走垃圾焚烧发电的道路。但他同时表示民众心理可以理解，“每一个人都知道应该建公共厕所，但都希望离自己家越远越好。”

　　中科院大连化学物理所和中科院研究生院的科研团队做过一份垃圾电厂的调查，其结果显示，在调查的19个样本中，16个样本的二恶英排放达到国家环保部目前的标准，只有6个样本达到欧盟标准（0.1TEQng/m3）。

　　中国能源问题专家林伯强对此忧虑的表示，中国的垃圾分类不如欧洲、日本细致，所以垃圾焚烧所产生的有害物质或会更大，“所以应该执行一个比欧盟更严格的标准”。林伯强同时认为，鉴于中国国情，垃圾发电是不得已的选择，“要求垃圾分类达到欧洲或日本的水平，没有10年不足以成功”。

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